Marlous Fluitsma groeide op in Nijmegen, waar haar vader leraar was. Na haar studie aan de Toneelacademie in Maastricht speelde ze achtereenvolgens bij het Groot Limburgs Toneel en de Haagse Comedie. Tegenwoordig is ze actief als trainer presentatie- en communicatievaardigheden.
Marlous werd bekend toen ze de hoofdrol speelde in het toneelstuk De Spinse (1973). Later speelde ze in de muzikale kinderserie Herman en de Zes, die werd uitgezonden door de KRO (1980/1982). Ook was ze te zien in de films Uit elkaar (1979), Ik ben Joep Meloen (1981) en de televisieseries Pommetje Horlepiep (1976) en De Fabriek (1981). In 1980 presenteerde Marlous Fluitsma het Eurovisiesongfestival in Den Haag.
In 1990 en 1991 speelde Marlous Fluitsma de rol van Helen Helmink in de televisieserie Goede Tijden, Slechte Tijden. Toen ze aangaf meer tijd aan haar gezin te willen besteden, werd haar rol overgenomen door Brûni Heinke. Het was voor het eerst dat een dergelijke gedaantewisseling in een Nederlandse televisieproductie plaatsvond.
Marlous Fluitsma was ook te zien als Eliza Zadelhof in de dramaserie Diamant (1993) en in de televisieserie Ernstige Delicten.