Kees Boot studeerde in 1995 af aan de Amsterdamse Toneelschool. Met zijn eigen gezelschap Tevengebroed maakte en speelde hij de voorstellingen Bierkaai, Kaalslag en OUT. Daarnaast was hij te zien in onder andere King Lear van het Amsterdamse Bos, Het belang van Ernst en Arturo Ui bij het N.N.T., Maat voor Maat bij het Nationale Toneel, Hooligans met ZEP en in Kamp Holland. Voor zijn rol van Wayne Hudson in Popcorn van ZEP won hij in 2003 de Arlecchino.
Op televisie was Kees onder andere te zien in de series All Stars, Baantjer, Spangen, Wildschut en de Vries, In voor en tegenspoed, Combat, Kind aan huis, Floor Faber, Flikken Maastricht, Spangas, Iedereen is Gek op Jack, Wat Als?, Naranjina en Het Zwarte Gat. Daarnaast speelde hij in de telefilms Maten, Benidorm en Ballast.
Kees Boot speelde ook in diverse bioscoopfilms, waaronder De zwarte meteoor, LEK, Mariken, Floris, Brief aan de Koning, Morrison, Radeloos, Moordwijven, De Indiaan, Mooi Leven, Plan C, Cop vs. Killer en Hoe duur was de suiker.
In 2006 was Kees te zien in een spraakmakende rol bij de productie One flew over the cuckoo’s nest van Joop van den Ende met Victor Low en Simone Kleinsma. De samenwerking met Joop van den Ende beviel zo goed dat hij in hetzelfde seizoen gevraagd werd voor de rol van Mickey Deans, naast Paul de Leeuw en Simone Kleinsma, in de productie Aan het Einde van de Regenboog. Hierna was hij te zien in Moeder Courage, Ciske de Rat en Petticoat.
Kees Boot spreekt diverse voice overs in, onder andere voor De Wereld Rond in 80 Dates en Overtreders.